NECTIN1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
NECTIN1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи NECTIN1, CD111, CLPED1, ED4, HIgR, HV1S, HVEC, OFC7, PRR, PRR1, PVRR, PVRR1, SK-12, nectin-1, PVRL1, nectin cell adhesion molecule 1
Зовнішні ІД OMIM: 600644 MGI: 1926483 HomoloGene: 2138 GeneCards: NECTIN1
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_203286
NM_002855
NM_032767
NM_203285
NM_021424
RefSeq (білок)
NP_002846
NP_976030
NP_976031
NP_067399
Локус (UCSC) Хр. 11: 119.62 – 119.73 Mb Хр. 9: 43.66 – 43.74 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NECTIN1 (англ. Nectin cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 517 амінокислот, а молекулярна маса — 57 158[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MARMGLAGAAGRWWGLALGLTAFFLPGVHSQVVQVNDSMYGFIGTDVVLH
CSFANPLPSVKITQVTWQKSTNGSKQNVAIYNPSMGVSVLAPYRERVEFL
RPSFTDGTIRLSRLELEDEGVYICEFATFPTGNRESQLNLTVMAKPTNWI
EGTQAVLRAKKGQDDKVLVATCTSANGKPPSVVSWETRLKGEAEYQEIRN
PNGTVTVISRYRLVPSREAHQQSLACIVNYHMDRFKESLTLNVQYEPEVT
IEGFDGNWYLQRMDVKLTCKADANPPATEYHWTTLNGSLPKGVEAQNRTL
FFKGPINYSLAGTYICEATNPIGTRSGQVEVNITEFPYTPSPPEHGRRAG
PVPTAIIGGVAGSILLVLIVVGGIVVALRRRRHTFKGDYSTKKHVYGNGY
SKAGIPQHHPPMAQNLQYPDDSDDEKKAGPLGGSSYEEEEEEEEGGGGGE
RKVGGPHPKYDEDAKRPYFTVDEAEARQDGYGDRTLGYQYDPEQLDLAEN
MVSQNDGSFISKKEWYV

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • Geraghty R.J., Krummenacher C., Cohen G.H., Eisenberg R.J., Spear P.G. (1998). Entry of alphaherpesviruses mediated by poliovirus receptor-related protein 1 and poliovirus receptor. Science. 280: 1618—1620. PMID 9616127 DOI:10.1126/science.280.5369.1618
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9706 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, Q15223 (англ.) . Архів оригіналу за 16 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]