Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
DBX1
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| DBX1, developing brain homeobox 1, HLX1 |
---|
Зовнішні ІД |
MGI: 94867 HomoloGene: 19002 GeneCards: DBX1
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • ventral spinal cord interneuron specification • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cell differentiation in spinal cord
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 11: 20.16 – 20.16 Mb
| Хр. 7: 49.28 – 49.29 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
DBX1 (англ. Developing brain homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 343 амінокислот, а молекулярна маса — 37 283[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MMFPGLLAPP | | AGYPSLLRPT | | PTLTLPQSLQ | | SAFSGHSSFL | | VEDLIRISRP |
PAYLPRSVPT | | ASMSPPRQGA | | PTALTDTGAS | | DLGSPGPGSR | | RGGSPPTAFS |
PASETTFLKF | | GVNAILSSGP | | RTETSPALLQ | | SVPPKTFAFP | | YFEGSFQPFI |
RSSYFPASSS | | VVPIPGTFSW | | PLAARGKPRR | | GMLRRAVFSD | | VQRKALEKMF |
QKQKYISKPD | | RKKLAAKLGL | | KDSQVKIWFQ | | NRRMKWRNSK | | ERELLSSGGC |
REQTLPTKLN | | PHPDLSDVGQ | | KGPGNEEEEE | | GPGSPSHRLA | | YHASSDPQHL |
RDPRLPGPLP | | PSPAHSSSPG | | KPSDFSDSEE | | EEEGEEQEEI | | TVS |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|