Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MSX2
|
---|
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/57/Protein_MSX2_PDB_1ig7.png/250px-Protein_MSX2_PDB_1ig7.png) |
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| MSX2, CRS2, FPP, HOX8, MSH, PFM, PFM1, Msh homeobox 2 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 123101 MGI: 97169 HomoloGene: 1837 GeneCards: MSX2
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Parietal foramina with cleidocranial dysplasia, parietal foramina[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • гіалоплазма • nuclear speck
|
---|
Біологічний процес |
• negative regulation of cell population proliferation • positive regulation of timing of catagen • negative regulation of keratinocyte differentiation • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • embryonic limb morphogenesis • frontal suture morphogenesis • mammary gland epithelium development • BMP signaling pathway involved in heart development • enamel mineralization • осифікація • anterior/posterior pattern specification • bone morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to growth factor stimulus • activation of meiosis • endochondral bone growth • wound healing, spreading of epidermal cells • BMP signaling pathway • embryonic digit morphogenesis • positive regulation of mesenchymal cell apoptotic process • multicellular organism development • embryonic hindlimb morphogenesis • negative regulation of CREB transcription factor activity • outflow tract morphogenesis • bone trabecula formation • Загоєння ран • regulation of apoptotic process • chondrocyte development • osteoblast development • positive regulation of osteoblast differentiation • cranial suture morphogenesis • negative regulation of fat cell differentiation • branching involved in mammary gland duct morphogenesis • outflow tract septum morphogenesis • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • osteoblast differentiation • epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation • positive regulation of BMP signaling pathway • signal transduction involved in regulation of gene expression • cellular response to estradiol stimulus • embryonic forelimb morphogenesis • embryonic nail plate morphogenesis • negative regulation of apoptotic process • cartilage development • stem cell differentiation • odontogenesis • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic morphogenesis
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bd/PBB_GE_MSX2_205555_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_MSX2_205555_s_at_fs.png)
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/08/PBB_GE_MSX2_210319_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_MSX2_210319_x_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 5: 174.72 – 174.73 Mb
| н/д
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
MSX2 (англ. Msh homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 267 амінокислот, а молекулярна маса — 28 897[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASPSKGNDL | | FSPDEEGPAV | | VAGPGPGPGG | | AEGAAEERRV | | KVSSLPFSVE |
ALMSDKKPPK | | EASPLPAESA | | SAGATLRPLL | | LSGHGAREAH | | SPGPLVKPFE |
TASVKSENSE | | DGAAWMQEPG | | RYSPPPRHMS | | PTTCTLRKHK | | TNRKPRTPFT |
TSQLLALERK | | FRQKQYLSIA | | ERAEFSSSLN | | LTETQVKIWF | | QNRRAKAKRL |
QEAELEKLKM | | AAKPMLPSSF | | SLPFPISSPL | | QAASIYGASY | | PFHRPVLPIP |
PVGLYATPVG | | YGMYHLS |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, остеогенез, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|