Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NFATC4
Ідентифікатори
Символи
NFATC4 , NF-AT3, NF-ATC4, NFAT3, nuclear factor of activated T-cells 4, nuclear factor of activated T cells 4
Зовнішні ІД
OMIM : 602699 MGI: 1920431 HomoloGene: 3349 GeneCards: NFATC4
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • peroxisome proliferator activated receptor binding • chromatin binding
Клітинна компонента
• transcription regulator complex • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck
Біологічний процес
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to lithium ion • negative regulation of chromatin binding • cellular response to UV • negative regulation of Wnt signaling pathway • calcineurin-NFAT signaling cascade • positive regulation of apoptotic signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of protein binding • smooth muscle cell differentiation • transcription, DNA-templated • regulation of synaptic plasticity • negative regulation of synapse maturation • heart development • negative regulation of dendrite morphogenesis • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • positive regulation of tumor necrosis factor production • branching involved in blood vessel morphogenesis • клітинне дихання • positive regulation of apoptotic process • inflammatory response • muscle cell development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • cellular response to ionomycin • GO:0032617 cytokine production • довготривала пам'ять • brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • довготривала потенціація • multicellular organism development
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 14: 24.37 – 24.38 Mb
Хр. 14: 56.06 – 56.07 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
NFATC4 (англ. Nuclear factor of activated T-cells 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 902 амінокислот , а молекулярна маса — 95 449[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MGAASCEDEE LEFKLVFGEE KEAPPLGAGG LGEELDSEDA PPCCRLALGE
PPPYGAAPIG IPRPPPPRPG MHSPPPRPAP SPGTWESQPA RSVRLGGPGG
GAGGAGGGRV LECPSIRITS ISPTPEPPAA LEDNPDAWGD GSPRDYPPPE
GFGGYREAGG QGGGAFFSPS PGSSSLSSWS FFSDASDEAA LYAACDEVES
ELNEAASRFG LGSPLPSPRA SPRPWTPEDP WSLYGPSPGG RGPEDSWLLL
SAPGPTPASP RPASPCGKRR YSSSGTPSSA SPALSRRGSL GEEGSEPPPP
PPLPLARDPG SPGPFDYVGA PPAESIPQKT RRTSSEQAVA LPRSEEPASC
NGKLPLGAEE SVAPPGGSRK EVAGMDYLAV PSPLAWSKAR IGGHSPIFRT
SALPPLDWPL PSQYEQLELR IEVQPRAHHR AHYETEGSRG AVKAAPGGHP
VVKLLGYSEK PLTLQMFIGT ADERNLRPHA FYQVHRITGK MVATASYEAV
VSGTKVLEMT LLPENNMAAN IDCAGILKLR NSDIELRKGE TDIGRKNTRV
RLVFRVHVPQ GGGKVVSVQA ASVPIECSQR SAQELPQVEA YSPSACSVRG
GEELVLTGSN FLPDSKVVFI ERGPDGKLQW EEEATVNRLQ SNEVTLTLTV
PEYSNKRVSR PVQVYFYVSN GRRKRSPTQS FRFLPVICKE EPLPDSSLRG
FPSASATPFG TDMDFSPPRP PYPSYPHEDP ACETPYLSEG FGYGMPPLYP
QTGPPPSYRP GLRMFPETRG TTGCAQPPAV SFLPRPFPSD PYGGRGSSFS
LGLPFSPPAP FRPPPLPASP PLEGPFPSQS DVHPLPAEGY NKVGPGYGPG
EGAPEQEKSR GGYSSGFRDS VPIQGITLEE VSEIIGRDLS GFPAPPGEEP
PA
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація клітин , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Hoey T., Sun Y.-L., Williamson K., Xu X. (1995). Isolation of two new members of the NF-AT gene family and functional characterization of the NF-AT proteins . Immunity . 2 : 461—472. PMID 7749981 DOI :10.1016/1074-7613(95)90027-6
Vihma H., Pruunsild P., Timmusk T. (2008). Alternative splicing and expression of human and mouse NFAT genes. Genomics . 92 : 279—291. PMID 18675896 DOI :10.1016/j.ygeno.2008.06.011
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Crabtree G.R. (1999). Generic signals and specific outcomes: signaling through Ca2+, calcineurin, and NF-AT. Cell . 96 : 611—614. PMID 10089876 DOI :10.1016/S0092-8674(00)80571-1
Yang T.T.C., Davis R.J., Chow C.-W. (2001). Requirement of two NFATc4 transactivation domains for CBP potentiation. J. Biol. Chem . 276 : 39569—39576. PMID 11514544 DOI :10.1074/jbc.M102961200
Yang T.T.C., Xiong Q., Enslen H., Davis R.J., Chow C.-W. (2002). Phosphorylation of NFATc4 by p38 mitogen-activated protein kinases . Mol. Cell. Biol . 22 : 3892—3904. PMID 11997522 DOI :10.1128/MCB.22.11.3892-3904.2002
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші