Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXB3
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| HOXB3, HOX2, HOX2G, Hox-2.7, homeobox B3 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 142966 MGI: 96184 HomoloGene: 1617 GeneCards: HOXB3
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• embryonic skeletal system morphogenesis • multicellular organism development • glossopharyngeal nerve morphogenesis • definitive hemopoiesis • thyroid gland development • cartilage development • face development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of neurogenesis • rhombomere development • Ангіогенез • hematopoietic progenitor cell differentiation • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/32/PBB_GE_HOXB3_208414_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_HOXB3_208414_s_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 17: 48.55 – 48.6 Mb
| Хр. 11: 96.21 – 96.24 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
HOXB3 (англ. Homeobox B3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 431 амінокислот, а молекулярна маса — 44 340[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQKATYYDNA | | AAALFGGYSS | | YPGSNGFGFD | | VPPQPPFQAA | | THLEGDYQRS |
ACSLQSLGNA | | APHAKSKELN | | GSCMRPGLAP | | EPLSAPPGSP | | PPSAAPTSAT |
SNSSNGGGPS | | KSGPPKCGPG | | TNSTLTKQIF | | PWMKESRQTS | | KLKNNSPGTA |
EGCGGGGGGG | | GGGGSGGSGG | | GGGGGGGGDK | | SPPGSAASKR | | ARTAYTSAQL |
VELEKEFHFN | | RYLCRPRRVE | | MANLLNLSER | | QIKIWFQNRR | | MKYKKDQKAK |
GLASSSGGPS | | PAGSPPQPMQ | | STAGFMNALH | | SMTPSYESPS | | PPAFGKAHQN |
AYALPSNYQP | | PLKGCGAPQK | | YPPTPAPEYE | | PHVLQANGGA | | YGTPTMQGSP |
VYVGGGGYAD | | PLPPPAGPSL | | YGLNHLSHHP | | SGNLDYNGAP | | PMAPSQHHGP |
CEPHPTYTDL | | SSHHAPPPQG | | RIQEAPKLTH | | L |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підро��ина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|