Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
RXRG
|
---|
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/42/Protein_RXRG_PDB_1by4.png/250px-Protein_RXRG_PDB_1by4.png) |
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| RXRG, NR2B3, RXRC, Retinoid X receptor gamma, RXR-gamma, RXRgamma |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 180247 MGI: 98216 HomoloGene: 21373 GeneCards: RXRG
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
синдром набутого імунного дефіциту[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
alitretinoin, bexarotene[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • зв'язування з іоном металу • sequence-specific DNA binding • steroid hormone receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма
|
---|
Біологічний процес |
• retinoic acid receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • protein homotetramerization • GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus • transcription, DNA-templated • steroid hormone mediated signaling pathway • transcription initiation from RNA polymerase II promoter
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/53/PBB_GE_RXRG_205954_at_fs.png/250px-PBB_GE_RXRG_205954_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 1: 165.4 – 165.45 Mb
| Хр. 1: 167.43 – 167.47 Mb
|
---|
PubMed search |
[3]
| [4] |
---|
Вікідані |
|
RXRG (англ. Retinoid X receptor gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 463 амінокислот, а молекулярна маса — 50 871[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MYGNYSHFMK | | FPAGYGGSPG | | HTGSTSMSPS | | AALSTGKPMD | | SHPSYTDTPV |
SAPRTLSAVG | | TPLNALGSPY | | RVITSAMGPP | | SGALAAPPGI | | NLVAPPSSQL |
NVVNSVSSSE | | DIKPLPGLPG | | IGNMNYPSTS | | PGSLVKHICA | | ICGDRSSGKH |
YGVYSCEGCK | | GFFKRTIRKD | | LIYTCRDNKD | | CLIDKRQRNR | | CQYCRYQKCL |
VMGMKREAVQ | | EERQRSRERA | | ESEAECATSG | | HEDMPVERIL | | EAELAVEPKT |
ESYGDMNMEN | | STNDPVTNIC | | HAADKQLFTL | | VEWAKRIPHF | | SDLTLEDQVI |
LLRAGWNELL | | IASFSHRSVS | | VQDGILLATG | | LHVHRSSAHS | | AGVGSIFDRV |
LTELVSKMKD | | MQMDKSELGC | | LRAIVLFNPD | | AKGLSNPSEV | | ETLREKVYAT |
LEAYTKQKYP | | EQPGRFAKLL | | LRLPALRSIG | | LKCLEHLFFF | | KLIGDTPIDT |
FLMEMLETPL | | QIT |
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|