Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
SIX2
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| SIX2, SIX homeobox 2 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 604994 MGI: 102778 HomoloGene: 56518 GeneCards: SIX2
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • transcription regulator complex
|
---|
Біологічний процес |
• embryonic skeletal system morphogenesis • regulation of chondrocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of chondrocyte proliferation • chondrocyte differentiation • protein import into nucleus • розвиток нирки • negative regulation of cell differentiation • anatomical structure morphogenesis • mesenchymal stem cell maintenance involved in nephron morphogenesis • mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis • mesenchymal cell differentiation involved in kidney development • mesenchymal stem cell proliferation • transcription by RNA polymerase II • regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • multicellular organism development • nephron morphogenesis • nephron development • middle ear morphogenesis • embryonic digestive tract morphogenesis • embryonic cranial skeleton morphogenesis • regulation of ossification • проліферація • mesodermal cell fate specification • anterior/posterior axis specification • metanephros development • cell migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • condensed mesenchymal cell proliferation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:1903374 anatomical structure development
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b7/PBB_GE_SIX2_206510_at_fs.png/250px-PBB_GE_SIX2_206510_at_fs.png)
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/aa/PBB_GE_SIX2_206511_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SIX2_206511_s_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 2: 45.01 – 45.01 Mb
| Хр. 17: 85.99 – 86 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
SIX2 (англ. SIX homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот, а молекулярна маса — 32 286[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSMLPTFGFT | | QEQVACVCEV | | LQQGGNIERL | | GRFLWSLPAC | | EHLHKNESVL |
KAKAVVAFHR | | GNFRELYKIL | | ESHQFSPHNH | | AKLQQLWLKA | | HYIEAEKLRG |
RPLGAVGKYR | | VRRKFPLPRS | | IWDGEETSYC | | FKEKSRSVLR | | EWYAHNPYPS |
PREKRELAEA | | TGLTTTQVSN | | WFKNRRQRDR | | AAEAKERENN | | ENSNSNSHNP |
LNGSGKSVLG | | SSEDEKTPSG | | TPDHSSSSPA | | LLLSPPPPGL | | PSLHSLGHPP |
GPSAVPVPVP | | GGGGADPLQH | | HHGLQDSILN | | PMSANLVDLG | | S |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|