Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TFAP4
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| TFAP4, AP-4, bHLHc41, transcription factor AP-4 (activating enhancer binding protein 4), transcription factor AP-4 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 600743 MGI: 103239 HomoloGene: 2424 GeneCards: TFAP4
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • protein dimerization activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • histone deacetylase binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • E-box binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
|
---|
Клітинна компонента |
• transcription repressor complex • клітинне ядро • мітохондрія
|
---|
Біологічний процес |
• negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • transcription, DNA-templated • negative regulation of gene expression • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator • cellular response to dexamethasone stimulus • negative regulation of DNA binding • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway • positive regulation of apoptotic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of mitotic cell cycle phase transition • GO:0034622 protein-containing complex assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 16: 4.26 – 4.27 Mb
| Хр. 16: 4.36 – 4.38 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
TFAP4 (англ. Transcription factor AP-4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 38 726[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEYFMVPTQK | | VPSLQHFRKT | | EKEVIGGLCS | | LANIPLTPET | | QRDQERRIRR |
EIANSNERRR | | MQSINAGFQS | | LKTLIPHTDG | | EKLSKAAILQ | | QTAEYIFSLE |
QEKTRLLQQN | | TQLKRFIQEL | | SGSSPKRRRA | | EDKDEGIGSP | | DIWEDEKAED |
LRREMIELRQ | | QLDKERSVRM | | MLEEQVRSLE | | AHMYPEKLKV | | IAQQVQLQQQ |
QEQVRLLHQE | | KLEREQQQLR | | TQLLPPPAPT | | HHPTVIVPAP | | PPPPSHHINV |
VTMGPSSVIN | | SVSTSRQNLD | | TIVQAIQHIE | | GTQEKQELEE | | EQRRAVIVKP |
VRSCPEAPTS | | DTASDSEASD | | SDAMDQSREE | | PSGDGELP |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|