Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
RFX3
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| RFX3, regulatory factor X3 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 601337 MGI: 106582 HomoloGene: 7917 GeneCards: RFX3
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• transcription regulator complex • клітинне ядро • extracellular region
|
---|
Біологічний процес |
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of type B pancreatic cell development • regulation of insulin secretion • epithelial cilium movement involved in determination of left/right asymmetry • cell maturation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • type B pancreatic cell maturation • determination of left/right symmetry • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cilium-dependent cell motility • endocrine pancreas development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • type B pancreatic cell differentiation • cilium assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/24/PBB_GE_RFX3_207234_at_fs.png/250px-PBB_GE_RFX3_207234_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 9: 3.22 – 3.53 Mb
| Хр. 19: 27.74 – 27.99 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
RFX3 (англ. Regulatory factor X3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 749 амінокислот, а молекулярна маса — 83 530[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQTSETGSDT | | GSTVTLQTSV | | ASQAAVPTQV | | VQQVPVQQQV | | QQVQTVQQVQ |
HVYPAQVQYV | | EGSDTVYTNG | | AIRTTTYPYT | | ETQMYSQNTG | | GNYFDTQGSS |
AQVTTVVSSH | | SMVGTGGIQM | | GVTGGQLISS | | SGGTYLIGNS | | MENSGHSVTH |
TTRASPATIE | | MAIETLQKSD | | GLSTHRSSLL | | NSHLQWLLDN | | YETAEGVSLP |
RSTLYNHYLR | | HCQEHKLDPV | | NAASFGKLIR | | SIFMGLRTRR | | LGTRGNSKYH |
YYGIRVKPDS | | PLNRLQEDMQ | | YMAMRQQPMQ | | QKQRYKPMQK | | VDGVADGFTG |
SGQQTGTSVE | | QTVIAQSQHH | | QQFLDASRAL | | PEFGEVEISS | | LPDGTTFEDI |
KSLQSLYREH | | CEAILDVVVN | | LQFSLIEKLW | | QTFWRYSPST | | PTDGTTITES |
SNLSEIESRL | | PKAKLITLCK | | HESILKWMCN | | CDHGMYQALV | | EILIPDVLRP |
IPSALTQAIR | | NFAKSLEGWL | | SNAMNNIPQR | | MIQTKVAAVS | | AFAQTLRRYT |
SLNHLAQAAR | | AVLQNTSQIN | | QMLSDLNRVD | | FANVQEQASW | | VCQCDDNMVQ |
RLETDFKMTL | | QQQSTLEQWA | | AWLDNVMMQA | | LKPYEGRPSF | | PKAARQFLLK |
WSFYSSMVIR | | DLTLRSAASF | | GSFHLIRLLY | | DEYMFYLVEH | | RVAQATGETP |
IAVMGEFGDL | | NAVSPGNLDK | | DEGSEVESEM | | DEELDDSSEP | | QAKREKTELS |
QAFPVGCMQP | | VLETGVQPSL | | LNPIHSEHIV | | TSTQTIRQCS | | ATGNTYTAV |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|