Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
FOXN1
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| FOXN1, FKHL20, RONU, WHN, forkhead box N1, TIDAND, TLIND |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 600838 MGI: 102949 HomoloGene: 2664 GeneCards: FOXN1
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
T-cell immunodeficiency, congenital alopecia, and nail dystrophy[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• hair follicle development • defense response • nail development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • blood vessel morphogenesis • thymus epithelium morphogenesis • thymus development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • lymphocyte homeostasis • positive regulation of hair follicle development • epithelial cell proliferation • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of positive thymic T cell selection • keratinocyte differentiation • lymphoid lineage cell migration into thymus • T cell homeostasis • multicellular organism development • regulation of T cell differentiation in thymus • epidermis development • animal organ morphogenesis • регуляція експресії генів • проліферація • T cell lineage commitment • positive regulation of epithelial cell differentiation • диференціація клітин • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • кровотворення
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4a/PBB_GE_FOXN1_207683_at_fs.png/250px-PBB_GE_FOXN1_207683_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 17: 28.51 – 28.54 Mb
| Хр. 11: 78.25 – 78.28 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
FOXN1 (англ. Forkhead box N1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 648 амінокислот, а молекулярна маса — 68 925[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVSLPPPQSD | | VTLPGPTRLE | | GERQGDLMQA | | PGLPGSPAPQ | | SKHAGFSCSS |
FVSDGPPERT | | PSLPPHSPRI | | ASPGPEQVQG | | HCPAGPGPGP | | FRLSPSDKYP |
GFGFEEAAAS | | SPGRFLKGSH | | APFHPYKRPF | | HEDVFPEAET | | TLALKGHSFK |
TPGPLEAFEE | | IPVDVAEAEA | | FLPGFSAEAW | | CNGLPYPSQE | | HGPQVLGSEV |
KVKPPVLESG | | AGMFCYQPPL | | QHMYCSSQPP | | FHQYSPGGGS | | YPIPYLGSSH |
YQYQRMAPQA | | STDGHQPLFP | | KPIYSYSILI | | FMALKNSKTG | | SLPVSEIYNF |
MTEHFPYFKT | | APDGWKNSVR | | HNLSLNKCFE | | KVENKSGSSS | | RKGCLWALNP |
AKIDKMQEEL | | QKWKRKDPIA | | VRKSMAKPEE | | LDSLIGDKRE | | KLGSPLLGCP |
PPGLSGSGPI | | RPLAPPAGLS | | PPLHSLHPAP | | GPIPGKNPLQ | | DLLMGHTPSC |
YGQTYLHLSP | | GLAPPGPPQP | | LFPQPDGHLE | | LRAQPGTPQD | | SPLPAHTPPS |
HSAKLLAEPS | | PARTMHDTLL | | PDGDLGTDLD | | AINPSLTDFD | | FQGNLWEQLK |
DDSLALDPLV | | LVTSSPTSSS | | MPPPQPPPHC | | FPPGPCLTET | | GSGAGDLAAP |
GSGGSGALGD | | LHLTTLYSAF | | MELEPTPPTA | | PAGPSVYLSP | | SSKPVALA |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|