Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NKX6-1
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| NKX6-1, NKX6.1, NKX6A, NK6 homeobox 1 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 602563 MGI: 1206039 HomoloGene: 4495 GeneCards: NKX6-1
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • екзосома
|
---|
Біологічний процес |
• smoothened signaling pathway • detection of glucose • pancreas development • transcription, DNA-templated • regulation of axon extension • multicellular organism development • cellular response to peptide hormone stimulus • central nervous system neuron differentiation • response to nicotine • negative regulation of glial cell differentiation • type B pancreatic cell proliferation • cellular response to cytokine stimulus • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • Нейрогенез • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • type B pancreatic cell development • positive regulation of neuron differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of type B pancreatic cell development • type B pancreatic cell maturation • oligodendrocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • проліферація • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of glial cell differentiation • диференціація клітин • positive regulation of insulin secretion • animal organ morphogenesis • regulation of neuron migration • neuron migration • regulation of insulin secretion • endocrine pancreas development • type B pancreatic cell differentiation
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 4: 84.49 – 84.5 Mb
| Хр. 5: 101.81 – 101.81 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
NKX6-1 (англ. NK6 homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 367 амінокислот, а молекулярна маса — 37 849[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLAVGAMEGT | | RQSAFLLSSP | | PLAALHSMAE | | MKTPLYPAAY | | PPLPAGPPSS |
SSSSSSSSSP | | SPPLGTHNPG | | GLKPPATGGL | | SSLGSPPQQL | | SAATPHGIND |
ILSRPSMPVA | | SGAALPSASP | | SGSSSSSSSS | | ASASSASAAA | | AAAAAAAAAA |
SSPAGLLAGL | | PRFSSLSPPP | | PPPGLYFSPS | | AAAVAAVGRY | | PKPLAELPGR |
TPIFWPGVMQ | | SPPWRDARLA | | CTPHQGSILL | | DKDGKRKHTR | | PTFSGQQIFA |
LEKTFEQTKY | | LAGPERARLA | | YSLGMTESQV | | KVWFQNRRTK | | WRKKHAAEMA |
TAKKKQDSET | | ERLKGASENE | | EEDDDYNKPL | | DPNSDDEKIT | | QLLKKHKSSS |
GGGGGLLLHA | | SEPESSS |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|