Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HES5
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| HES5, bHLHb38, hes family bHLH transcription factor 5 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 607348 MGI: 104876 HomoloGene: 7755 GeneCards: HES5
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • protein dimerization activity • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • double-stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • sequence-specific DNA binding • sequence-specific double-stranded DNA binding
|
---|
Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро • компонент клітини
|
---|
Біологічний процес |
• Сигнальний шлях Notch • auditory receptor cell fate determination • establishment of epithelial cell polarity • диференціація клітин • negative regulation of astrocyte differentiation • regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • inner ear receptor cell stereocilium organization • comma-shaped body morphogenesis • metanephric nephron tubule morphogenesis • chondrocyte differentiation • central nervous system myelination • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cell maturation • negative regulation of forebrain neuron differentiation • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • negative regulation of stem cell differentiation • neuronal stem cell population maintenance • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • glial cell fate commitment • telencephalon development • brain development • inner ear auditory receptor cell differentiation • адгезія клітин • astrocyte differentiation • cartilage development • forebrain radial glial cell differentiation • regulation of myelination • negative regulation of oligodendrocyte differentiation • S-shaped body morphogenesis • neural tube development • neuron differentiation • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of BMP signaling pathway • negative regulation of pro-B cell differentiation • регуляція диференціювання клітин • smoothened signaling pathway • oligodendrocyte development • camera-type eye development • specification of loop of Henle identity • regulation of epithelial cell proliferation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of inner ear receptor cell differentiation • regulation of neurogenesis • positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • positive regulation of Notch signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • GO:0034622 protein-containing complex assembly • somitogenesis • central nervous system development • anterior/posterior pattern specification • negative regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 1: 2.53 – 2.53 Mb
| Хр. 4: 155.05 – 155.05 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
HES5 (англ. Hes family bHLH transcription factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 166 амінокислот, а молекулярна маса — 18 226[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPSTVAVEL | | LSPKEKNRLR | | KPVVEKMRRD | | RINSSIEQLK | | LLLEQEFARH |
QPNSKLEKAD | | ILEMAVSYLK | | HSKAFVAAAG | | PKSLHQDYSE | | GYSWCLQEAV |
QFLTLHAASD | | TQMKLLYHFQ | | RPPAAPAAPA | | KEPKAPGAAP | | PPALSAKATA |
AAAAAHQPAC | | GLWRPW |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, нейрогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of human HES2, HES3, and HES5 genes in silico. Int. J. Oncol. 25: 529—534. PMID 15254753
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|