Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TBR1
|
---|
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4f/TBR1_Protein.png/250px-TBR1_Protein.png) |
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| TBR1, TBR-1, TES-56, T-box, brain 1, IDDAS, T-box brain transcription factor 1 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 604616 MGI: 107404 HomoloGene: 4807 GeneCards: TBR1
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
атиповий аутизм, аутизм[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain • регуляція експресії генів • regulation of axon guidance • brain development • hindbrain development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • amygdala development • regulation of neuron projection development • transcription, DNA-templated • specification of animal organ identity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • conditioned taste aversion • neuron differentiation • cerebral cortex development
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Вид�� |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 2: 161.42 – 161.43 Mb
| Хр. 2: 61.63 – 61.64 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
TBR1 (англ. T-box, brain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 682 амінокислот, а молекулярна маса — 74 053[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQLEHCLSPS | | IMLSKKFLNV | | SSSYPHSGGS | | ELVLHDHPII | | STTDNLERSS |
PLKKITRGMT | | NQSDTDNFPD | | SKDSPGDVQR | | SKLSPVLDGV | | SELRHSFDGS |
AADRYLLSQS | | SQPQSAATAP | | SAMFPYPGQH | | GPAHPAFSIG | | SPSRYMAHHP |
VITNGAYNSL | | LSNSSPQGYP | | TAGYPYPQQY | | GHSYQGAPFY | | QFSSTQPGLV |
PGKAQVYLCN | | RPLWLKFHRH | | QTEMIITKQG | | RRMFPFLSFN | | ISGLDPTAHY |
NIFVDVILAD | | PNHWRFQGGK | | WVPCGKADTN | | VQGNRVYMHP | | DSPNTGAHWM |
RQEISFGKLK | | LTNNKGASNN | | NGQMVVLQSL | | HKYQPRLHVV | | EVNEDGTEDT |
SQPGRVQTFT | | FPETQFIAVT | | AYQNTDITQL | | KIDHNPFAKG | | FRDNYDTIYT |
GCDMDRLTPS | | PNDSPRSQIV | | PGARYAMAGS | | FLQDQFVSNY | | AKARFHPGAG |
AGPGPGTDRS | | VPHTNGLLSP | | QQAEDPGAPS | | PQRWFVTPAN | | NRLDFAASAY |
DTATDFAGNA | | ATLLSYAAAG | | VKALPLQAAG | | CTGRPLGYYA | | DPSGWGARSP |
PQYCGTKSGS | | VLPCWPNSAA | | AAARMAGANP | | YLGEEAEGLA | | AERSPLPPGA |
AEDAKPKDLS | | DSSWIETPSS | | IKSIDSSDSG | | IYEQAKRRRI | | SPADTPVSES |
SSPLKSEVLA | | QRDCEKNCAK | | DISGYYGFYS | | HS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|