Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NR1H3
|
---|
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b3/Protein_NR1H3_PDB_1uhl.png/250px-Protein_NR1H3_PDB_1uhl.png) |
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| NR1H3, LXR-a, LXRA, RLD-1, Liver X receptor alpha, nuclear receptor subfamily 1 group H member 3 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 602423 MGI: 1352462 HomoloGene: 21165 GeneCards: NR1H3
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
метаболічні захворювання[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
(25R)-cholest-5-ene-3β,26-diol, desmosterol[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• cholesterol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • sterol response element binding • steroid hormone receptor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity
|
---|
Клітинна компонента |
• receptor complex • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро • цитоплазма
|
---|
Біологічний процес |
• positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway • sterol homeostasis • negative regulation of pancreatic juice secretion • negative regulation of inflammatory response • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of lipid transport • positive regulation of lipoprotein lipase activity • lipid homeostasis • triglyceride homeostasis • negative regulation of macrophage activation • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation • positive regulation of cholesterol transport • negative regulation of cholesterol storage • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of triglyceride biosynthetic process • positive regulation of cholesterol efflux • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process • negative regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • regulation of circadian rhythm • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • response to progesterone • steroid hormone mediated signaling pathway • apoptotic cell clearance • positive regulation of fatty acid biosynthetic process • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of secretion of lysosomal enzymes • negative regulation of pinocytosis • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • intracellular receptor signaling pathway • cholesterol homeostasis • lipid metabolism • multicellular organism development • диференціація клітин • negative regulation of cold-induced thermogenesis
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](https://cdn.statically.io/img/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/96/PBB_GE_NR1H3_203920_at_fs.png/250px-PBB_GE_NR1H3_203920_at_fs.png) |
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 11: 47.25 – 47.27 Mb
| Хр. 2: 91.01 – 91.03 Mb
|
---|
PubMed search |
[3]
| [4] |
---|
Вікідані |
|
NR1H3 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group H member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 447 амінокислот, а молекулярна маса — 50 396[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSLWLGAPVP | | DIPPDSAVEL | | WKPGAQDASS | | QAQGGSSCIL | | REEARMPHSA |
GGTAGVGLEA | | AEPTALLTRA | | EPPSEPTEIR | | PQKRKKGPAP | | KMLGNELCSV |
CGDKASGFHY | | NVLSCEGCKG | | FFRRSVIKGA | | HYICHSGGHC | | PMDTYMRRKC |
QECRLRKCRQ | | AGMREECVLS | | EEQIRLKKLK | | RQEEEQAHAT | | SLPPRASSPP |
QILPQLSPEQ | | LGMIEKLVAA | | QQQCNRRSFS | | DRLRVTPWPM | | APDPHSREAR |
QQRFAHFTEL | | AIVSVQEIVD | | FAKQLPGFLQ | | LSREDQIALL | | KTSAIEVMLL |
ETSRRYNPGS | | ESITFLKDFS | | YNREDFAKAG | | LQVEFINPIF | | EFSRAMNELQ |
LNDAEFALLI | | AISIFSADRP | | NVQDQLQVER | | LQHTYVEALH | | AYVSIHHPHD |
RLMFPRMLMK | | LVSLRTLSSV | | HSEQVFALRL | | QDKKLPPLLS | | EIWDVHE |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|